幽門螺桿菌本身與大便不成形、腹瀉無關。但在治療幽門螺桿菌時，可能會出現大便不成形、腹瀉等癥狀。幽門螺桿菌主要定植在胃內，可引起胃內的病變。臨床上70%的患者在感染幽門螺桿菌后會表現為慢性活動性胃炎，多數患者無癥狀，僅可通過查體被發現。10%左右的患者可能會出現消化不良癥狀，如早飽、腹脹等。10%-15%的患者會出現消化性潰瘍，包括胃潰瘍與十二指腸球部潰瘍，主要表現為上腹隱痛、空腹痛以及夜間痛等癥狀。還存在不到1%的患者可能會出現胃惡性腫瘤。對于存在危險因素的人群，如一級家屬患有胃癌或既往患有萎縮性胃炎、消化性潰瘍、糜爛性胃炎以及存在胃部手術病史的患者，應積極根除幽門螺桿菌，以防出現嚴重的疾病。臨床上對于幽門螺桿菌的治療，主要采取四聯療法，包括兩種抗生素、質子泵抑制劑以及鉍劑。而大量使用抗生素可能會導致腸道菌群失調，從而引起抗生素相關性腹瀉。