幽門螺桿菌感染，通常不會引起腹瀉癥狀。因幽門螺桿菌侵入消化道后，主要在胃竇黏膜的黏液下、黏膜上皮上定值，對胃黏膜產生影響。由于毒素影響，會對胃黏膜造成損傷和炎癥，會出現幽門螺桿菌相關的胃炎發生，不會影響腸道功能。而腹瀉常由于腸道功能出現異常，比如存在其他細菌的感染，腸道部分致病菌導致腸炎發生，從而出現腹瀉。還可能因飲食不當，比如食用較多不易消化、不清潔或不新鮮的食物，導致腸道功能出現短暫的紊亂，腸道蠕動加快或腸道內的黏膜充血、水腫以后滲出增加，導致腹瀉發生。所以幽門螺桿菌的感染主要影響胃而不是腸，因此通常不會出現腹瀉或腹疼的癥狀。