重建腸內菌群少則需要1個月，多則數月甚至數年。導致腸道菌群紊亂的原因，可能是服用抗生素，或者進食了辛辣、刺激性食物，還有可能是消化功能不全導致的腸道紊亂情況。根據不同情況，腸內菌群重建的時間不同。例如服用抗生素后出現腸道菌群紊亂，這時通過益生菌補充，通常1個月內腸道菌群就可能達到重建。對于長期吃辛辣、刺激、不消化的食物，即使在補充益生菌的同時，由于造成傷害的因素沒有去除，就會遷延不愈、反復出現。所以對于重建腸內菌群，除補充益生菌外，要需注意生活方式和飲食結構。生活方面要按時休息、勞逸結合，一日三餐定時、定量。還要注意飲食結構，例如要進食清淡、易消化的食物，避免進食辛辣食物。所以腸內菌群的重建，與飲食結構、生活方式密切相關。