腸結核好發的部位是回腸末端、回盲瓣，由于結核桿菌在腸道的這個部位停留的時間過長，所以會導致此部位發病，臨床表現是腹痛、腹部包塊，也可能是便秘與腹瀉相交替。除了腹部癥狀以外，還有腸結核的全身表現，如低熱、納差、盜汗等，也可以出現明顯的消瘦。通常做結腸鏡檢查可發現回盲瓣、回腸末端出現大小不等的潰瘍，潰瘍往往是環周生長，且有時是鼠噬樣，有些患者的潰瘍周圍出現息肉增生樣的改變，做病理檢測有時會發現抗酸染色陽性，病理特殊的檢測還可能發現結核桿菌。大多數患者通過病理直接檢測到結核桿菌相對少見，主要是通過血液抽血化驗，比如結核干擾素的檢測方法，可以發現結核抗體是陽性。診斷腸結核需要通過臨床表現、內鏡下的表現、實驗室的檢查來綜合判定。如果證據相對不足，但高度懷疑的情況下，也可以進行實驗性治療，也就是給予結核的積極治療。如果是腸結核，2-3個月復查腸鏡，可以看到潰瘍明顯好轉。如果經過積極的、合理的、足量的抗結核治療后，癥狀沒有緩解，并且腸鏡下潰瘍沒有好轉，則需要轉換治療，有可能是其他疾病所引起。