細菌或者病毒引起喉嚨痛，后期可能出現全身癥狀或者局部表現，在相關的輔助檢查上可能會出現明顯區別。血象檢查中，細菌感染的患者通常伴有中性粒細胞和白細胞升高，病毒感染的患者中，通常伴隨淋巴細胞升高。早期時沒有明顯區別，均以咽痛為主，嚴重的可能伴有全身癥狀。如果在病毒中存在特殊類型，如皰疹病毒或者其它病毒感染，可能引起口腔黏膜出現水皰樣物質，皰疹病毒、細菌感染比較嚴重時，可能出現化膿，尤其在鏈球菌或者葡萄球菌感染時，可以看到扁桃體表面出現分泌物剝除。疼痛早期伴有發熱、渾身乏力，嬰幼兒可以見到食欲減退、哭鬧等，因此早期時癥狀可能沒有明顯區別，均以咽痛和全身癥狀表現為主。因此出現細菌和病毒的單純癥狀不容易判斷，可以通過相應的輔助檢查進行綜合判斷，再進一步決定臨床治療的方案。早期可以使用傳統中藥，如清熱解毒類中藥，同時多飲水，注意休息，對喉嚨痛具有一定好處。