病毒和細菌都是一種病原微生物，但是它們兩個有一定區別。從形態上說，病毒更細更小些，能夠通過濾菌器濾過，細菌就不能通過濾菌器濾過。另外細菌有細胞壁，病毒只有核酸和外邊的蛋白質外鞘組成，沒有細胞壁，所以它對抗生素是不敏感的，不能用抗生素來治療病毒感染。另外病毒復制的過程，一般都在細胞內完成，不能在細胞外完成病毒復制。相同點是這兩個病原微生物都可以引起人類感染許多疾病。