預防腦血栓常吃的藥物有阿司匹林、氯吡格雷、阿托伐他汀、瑞舒伐他汀、長春胺、尼麥角林等，這些藥有抗血管痙攣、抗血小板凝聚、降脂的作用，主要是針對腦血栓的病因來治療。造成腦血栓的常見原因為高血壓、高血脂、高血糖，這些病變都會造成腦血管硬化、痙攣、血液粘稠度增高，所以要針對病因制定相應的預防方案。如果有糖尿病，要加用降糖藥，有高血壓時要吃降壓藥，高血脂的病人吃他汀類的藥物，均為腦血栓最好的預防措施。但是腦血栓的預防分一級預防和二級預防，沒有得過腦血栓的病人，比得過腦血栓病人的預防，吃的藥要相對較少。