高位復雜型肛瘺因肛瘺內口位置較高，一般高于齒狀線以上或瘺口竇道較多，手術時應充分暴露內口，清除感染組織病灶及竇道組織，為達理想療效預防復發，高位復雜性肛瘺手術創面較大、深度較深、數量較多。伴隨醫學發展，學者逐漸認識到開放治療與保持肛門功能之間的矛盾關系，因此對高位復雜性肛瘺必須保持肛門括約肌功能越來越受到重視。目前為保護肛門括約肌功能，部分竇道不能完全切除，需掛線治療形成對肛門括約肌慢性切割作用，達到慢性瘢痕愈合。保存肛門括約肌功能，目前主要有以下幾種手術方式： 1、內口縫合藥物托管法； 2、內口封閉管道引流； 3、分段接力掛線治療，淺部切開，深部掛線治療； 4、高位復雜性肛瘺掛線治療； 5、部分特別復雜肛瘺需分三期實施，Ⅰ期，竇道開放，充分引流復雜性肛瘺使其成為單一創面。Ⅱ期完全閉合傷口，同時修補括約肌，對缺損皮膚進行皮瓣移植。Ⅲ期填塞閉合不嚴的縫隙，消除并發癥，使肛門括約肌恢復原有功能，通過手術及康復治療，患者控制稀便能力會明顯好轉。