肛瘺的癥狀是肛門周圍反復起膿包破潰流膿水，經久不愈反復發作。高位復雜性肛瘺，除肛門周圍潰口不能愈合，反復流膿水外，還會引起臀部大面積腫脹疼痛，患者坐臥不安，影響勞動，時間過長會引起肛瘺惡變。肛瘺惡變是由于高位復雜性肛瘺長期不治療或治療不恰當、不徹底，反復發作后引起的局部炎性刺激。重度肛瘺不能清除，刺激細胞突變引起惡變，在臨床上是危害較大的疾病。