高位復雜性肛瘺患者約占所有肛瘺患者的5%-10%。高位復雜性肛瘺對于肛腸科醫生而言為一種疑難雜癥，因為高位復雜性肛瘺的位置比較高，并且牽扯的組織比較多，層次比較復雜，所以其治療比較困難。肛瘺的根治方法為手術治療，所以高位復雜性肛瘺的根治方法亦為手術治療。因為每位高位復雜性肛瘺患者的瘺管走形不同，所牽扯到的組織結構不同，所以患者所選擇的手術方式亦不盡相同。但是臨床上有基礎性的手術原則，即在保護好肛門括約肌功能的基礎上進行手術治療，避免造成括約肌的損傷，造成肛門失禁。因為高位復雜性肛瘺手術的難度比較大，所以建議患者就醫的時候，盡量選正規的醫療單位進行就醫，并且建議患者盡量選一些手術經驗豐富，且知名度較高的專家進行手術。