患者出現慢性感染性腹瀉的常見病因如下：1、細菌感染：如志賀氏細菌感染會導致細菌性痢疾，以及沙門氏菌感染會導致傷寒等；2、病毒感染：如巨細胞病毒感染、EB病毒感染等；3、真菌感染：真菌感染是慢性腹瀉的常見病因，尤其免疫力較低的患者，如患有艾滋病或糖尿病的患者；4、原蟲感染：如阿米巴感染，可以導致患者出現慢性腹瀉；5、寄生蟲感染：包括腸道血吸蟲病、鞭蟲病；6、其他：包括經腸道結核感染，以及患者常使用抗生素的情況下可出現二重感染，進而引起腹瀉。