扁桃體是一對橢圓形組織，位于扁桃體隱窩內。扁桃體隱窩指口咽部外側壁，由腭舌弓和腭咽弓組成三角形區域，扁桃體外周有被膜包繞，其為疏松結締組織，與咽側肌肉組織相隔，形成潛在間隙。當扁桃體炎癥控制較差，炎癥向周圍蔓延時，扁桃體周圍間隙可形成感染，此時可出現扁桃體周圍炎。扁桃體是咽部淋巴組織的一部分，其本身是淋巴組織團，表面有較多腺窩。急性扁桃體炎發作時，扁桃體腺窩和扁桃體表面，可出現紅腫及膿液附著。當有慢性扁桃體炎時，扁桃體腺窩內可有干酪樣物質潴留。