乙肝相關性腎炎的鑒別診斷，根據病理類型、臨床表現和其他腎炎進行鑒別。乙肝相關性腎炎，有乙肝相關的膜性腎病以及乙肝相關的系膜毛細血管樣腎病，這兩種病理類型為多，主要和其他繼發性腎炎鑒別。 狼瘡性腎炎，首先患者是狼瘡，狼瘡11條符合4條就可以診斷狼瘡，患者有狼瘡性腎炎的表現，比如尿液化驗異常，有蛋白尿、血尿、管型尿，還有腎功能異常，比如尿素氮、肌酐升高，都是狼瘡性腎炎的表現。化驗血有抗核抗體陽性，雙鏈DNA陽性，史密斯抗體陽性，是狼瘡的診斷，可以通過這些診斷狼瘡性腎炎。還可以做腎活檢，狼瘡腎活檢可以看到狼瘡特殊的病理表現，也能輔助診斷狼瘡性腎炎。狼瘡和乙肝腎的鑒別是比較容易的，通過抽血化驗就能做到鑒別。 其他的繼發性腎炎，ANCA相關性血管炎的腎損害，也可以和乙肝相關性腎炎鑒別。ANCA相關性血管炎是多系統病變，可以看到其他系統的表現，比如消化道、肺、結膜等全身血管炎多處損害，血里面可以查到ANCA陽性等輔助鑒別。過敏性紫癜腎炎、妊娠腎炎也可以和乙肝相關腎炎鑒別，過敏性紫癜腎炎往往前面有過敏性紫癜的病史，皮膚紫癜、關節痛、腹痛的病史能輔助進行鑒別。