遷延性腹瀉或慢性腹瀉往往會導致小兒的營養不良，因長期腹瀉會影響營養物質的吸收，同時營養不良的孩子患腹瀉的概率也會較高。因營養不良會影響胃黏膜，導致胃黏膜萎縮，使胃液酸度降低，從而導致胃黏膜殺菌屏障作用明顯減弱，因此患兒就會出現消化不良，出現腹瀉。 同時，胃黏膜殺菌屏障作用明顯減弱后，細菌或病毒更易侵犯胃腸道黏膜，從而導致感染性腹瀉。因此，小兒的營養不良和腹瀉是互相影響的關系，故平時一定要注意小兒的飲食，使其營養均衡。