非梗阻性肥厚型心肌病患者的主要表現為室間隔，或者心尖部不均勻性增厚，不伴流出道梗阻，晚期可出現失代償性心腔擴大、心力衰竭，亦可出現肺淤血、不同程度的呼吸困難，以及體循環淤血，相關的頸動脈怒張、胸腔積液、腹腔積液、心包積液，雙下肢水腫等體征。還可出現一系列相關心律失常癥狀，包括室速、室早，甚至室顫，亦可由于心內膜受損而出現心室腹壁血栓，并發血栓栓塞性并發癥。非梗阻性肥厚型心肌病患者主要針對其并發癥進行處理，包括應用利尿劑、強心劑、血管緊張素轉換酶抑制劑、血管緊張素受體拮抗劑及β受體阻斷劑等，抑制心肌重構，改善心力衰竭。亦可根據并發心律失常應用胺碘酮等抗心律失常藥物治療，必要時針對惡性心律失常，如室速、室顫，可行埋藏式轉復除顫器植入，明確血栓形成后可應用華法林、達比加群、利伐沙班等抗凝藥物綜合治療，從而改善患者預后。