陰莖疼痛的原因通常包括以下幾種：1、生理性原因：陰莖有時陣發性抽痛或者刺痛，可能是由身體過度疲勞、有慢性壓力、熬夜、久坐、食用過多刺激性食物導致的局部反應。如果這種反應，身體調整以后可以消失，通常沒有問題；2、病理性原因：陰莖疼痛可能伴隨其它臨床表現，例如尿道分泌物、陰莖表面或者內部腫物，根據情況可能存在不同的病因，需要至醫院就診，判斷病因、進行治療，可能是尿道炎、陰莖腫瘤、陰莖硬結癥。但是臨床較為常見的是單純感覺陰莖疼痛，沒有其它癥狀。中老年人如果出現單純陰莖疼痛，較為常見的是陰莖海綿體纖維化，部分硬結癥的早期，可能硬結并不明顯，可能感覺陰莖勃起出現輕微脹痛。