致病的支原體中，肺炎支原體可以引起肺炎，人型支原體、解脲支原體和生殖支原體主要引起泌尿生殖道的感染。衣原體感染是各種衣原體感染所引起的一組感染性疾病，可以導致子宮感染、早產、流產、尿道感染、肺炎、支氣管炎、胃腸炎、腦脊髓炎、結膜炎、關節炎等多種疾病。衣原體感染也是一種常見的性傳播疾病，對衣原體感染有效的藥物對支原體的感染也有效。必要時可以采用四環素類藥物進行治療，比如常用的有多西環素、米諾環素。還有就是大環內酯類的藥物，比如紅霉素、羅紅霉素、阿奇霉素、克林霉素、克拉霉素等。還有就是喹諾酮類的藥物，有氧氟沙星、左氧氟沙星等。上述這些藥物可以用來治療生殖支原體的感染，療程一般是1-2周。紅霉素對人型支原體無效，而克林霉素對解脲支原體無效，因此在發現是這兩種支原體感染的時候，一定要避免使用這兩種藥物。