肺炎衣原體是介于細菌與病毒之間的較小微生物，專業術語叫非典型病原體，分為好多類型。 肺炎衣原體感染肺，即造成衣原體肺炎，衣原體肺炎常出現小范圍群體性感染，感染相對較輕，癥狀也較輕，個別抵抗力下降者相對更重，許多可以不治自愈。癥狀主要表現發熱、咳嗽、咳痰，痰量不多，體溫不高，少許呼吸困難。CT顯示肺磨玻璃樣改變，或較小結節，甚至出現間質性改變。