扁桃體肥大并非一定進行手術切除，需評估患者癥狀，可先選擇藥物保守治療，若藥物保守治療效果不佳，經醫生判斷可能手術切除的益處更大，此時再考慮進行手術切除。扁桃體肥大多發在兒童，由于免疫力不足，經常發生感冒、受涼，易導致咽喉發炎，通常可發生扁桃體發炎與扁桃體肥大。如果通過藥物治療，能夠控制住炎癥，扁桃體肥大縮小，且不反復發作，未造成睡眠打鼾或張口呼吸現象時，可不進行手術治療。若藥物治療不能獲得較好效果，如一年扁桃體發炎次數超過3-4次，或長期出現睡覺時打鼾，已經影響到兒童學習能力與頜面部發育時，采取手術切除扁桃體效果較好。