在大蒜素膠囊的說明書中，是對于此藥有過敏癥狀的患者禁止使用。孕婦和哺乳期婦女，未進行相應的試驗，也缺乏相關的臨床數據，因此也屬于不適宜的人群。另外該藥物屬于抗菌藥物，主要用于治療深部的真菌和細菌感染，如肺部和消化道霉菌的感染，還有白色念珠菌所導致的菌血癥，以及急慢性的細菌性痢疾，急慢性腸炎等。因此使用藥物時，還需要注意針對具有感染癥狀的患者進行使用。如果沒有上述癥狀，也屬于大蒜素膠囊的不適宜人群。患者如果沒有相應的感染癥狀，盲目使用大蒜素膠囊，可能導致藥物濫用，還有可能導致不良反應。此外大蒜素膠囊的說明書中提到，大蒜素對胃有一定的刺激性，而且容易被胃酸所破壞。因此服用膠囊時需整粒吞服，盡量不要將其咬破。咬破后可能導致其中的大蒜素對胃造成刺激，還可能被胃液中的胃酸破壞而滅活。