凌晨3點醒來睡不著的原因如下：一、生理原因：睡眠過早如前一天晚上9點鐘就上床自然睡眠，到第二天凌晨3點鐘醒來，已經睡6個多小時，作為中老年人來說，可能睡眠時間足夠，屬于生理現象。二、病理原因：1、如情緒性疾病，抑郁癥的患者容易出現早醒、睡眠時間不夠；2、嚴重大腦疾病，如缺血、缺氧性疾病造成早醒；3、嚴重全身性疾病，如貧血、心臟病、心力衰竭、肝腎功能損害、惡性疾病早期的遠隔效應等干擾睡眠，導致睡眠質量差，出現早醒現象。患者應該及時就診查明原因，改變環境或者使用營養支持療法等綜合措施，主要是針對病因進行治療，病因得到調整以后，再加上對癥治療就可以得到好的效果，可以爭取好的預后。