便秘并非身體缺少某種物質，多提示結腸運動紊亂。結腸運動依靠神經遞質支配，所以一些促動力藥有治療效果，比如莫沙必利等。便秘可能提示患者腸道里的5-羥色胺作用不強，使用提高5-羥色胺含量的藥物治療有效，頑固性便秘患者可以使用抗抑郁藥進行治療。 中醫認為便秘分氣虛便秘、血虛便秘、陰虛便秘等，屬于虛證，辨證為虛證的患者要通過滋陰溫腎方法進行調理。