三氧水一般不能治療幽門螺桿菌。幽門螺桿菌在胃黏膜黏液下和胃黏膜上皮表面定植，并不是在皮膚表面定植，且三氧水進入胃內后，難以保持其自身狀態，接觸胃液中的胃酸后失去功效，從而無法殺滅幽門螺桿菌。且上述方法沒有得到臨床驗證，也沒有相關臨床前研究證明三氧水具有殺滅幽門螺桿菌的作用。無論國內，還是國外治療幽門螺桿菌，一般采用質子泵抑制劑聯合抗菌素的方法，我國一般還需聯合鉍劑進行幽門螺桿菌的治療。