如果是由于疾病治療的需要，魚肝油和益生菌可以一起使用。魚肝油主要是由鯊魚、鱈魚等的肝臟中提煉出來的脂肪類物質，主要有效成分是維生素A和維生素D，主要適應證是用于預防和治療維生素A、維生素D的缺乏癥，如佝僂病、夜盲癥、嬰兒手足搐搦癥等。益生菌屬于活菌制劑，包括二聯活菌、三聯活菌、四聯活菌等，主要作用是用于調節人體腸道菌群。益生菌食用時可以和食物同服，也可以和牛奶、果汁等飲料一起服用。魚肝油同樣也可以和食物一起服用，所以如果是由于疾病治療的需要，益生菌和魚肝油可以一起食用。魚肝油不可以盲目、長期、過量服用，否則可能導致慢性中毒癥狀，包括骨關節疼痛、口唇干裂、皮膚瘙癢、發熱、疼痛等癥狀，高鈣血癥、高磷血癥的患者禁忌使用魚肝油。