甲肝病毒傳播途徑主要是糞-口途徑，即消化道傳播。甲肝的傳染源是甲肝患者和病原攜帶者，甲肝病毒主要存在于甲肝患者和病原攜帶者的糞便中，因此糞便會含有大量病毒，從潛伏期末，患者沒有出現任何臨床表現時，即可向外排甲肝病毒，一直到患者起病后30天，甚至40天都具有傳染性。如果患者糞便污染周圍環境，可以通過糞-口途徑污染水源或食物，或通過手污染，傳染周圍的食物和水源，或通過蒼蠅作為傳播媒介引起食物污染，都可以引起甲肝的傳播。水源污染和食物污染造成甲肝會引起暴發流行，特別是水源污染。