食管鏡和胃鏡均屬于內鏡，分為硬式內鏡和軟式內鏡，也稱纖維內鏡，主要在臨床應用上面進行區分，具體如下：1、不同點：食管鏡臨床應用較少，目前大部分醫院沒有食管鏡，因為食管檢查和治療很大程度上被胃鏡代替。食管鏡較短，主要觀察食道，包括食道下病變，如只需進行食道部位治療時可以酌情使用。胃鏡需要經過食道，從咽喉部經食道進入胃、十二指腸，直到十二指腸降部再退鏡，進行內鏡下活檢、治療等。胃鏡可以代替食管鏡，且不局限于觀察食管，可以將整個胃，包括十二指腸整體觀察，再酌情進行處置；2、相同點：從病人感受方面，兩者均經過咽喉部，均有異物感，以及惡心的感覺，對于內鏡操作醫生來講只是觀察范圍不同。