確定危險度或者良惡性一般是根據腫瘤大小、核分裂象、生長部位、腫瘤有無破裂或穿孔等。一般腫瘤直徑＜2cm，核分裂象＜5個，即可確定為極低危險度的胃腸間質瘤。極低危險度的間質瘤手術以后一般不需要再輔助藥物治療，對中高危以上的胃腸間質瘤，手術以后則要用靶向藥物來繼續輔助治療。 胃腸間質瘤是一種比較少見的胃腸道腫瘤，胃腸道腫瘤最常見的是胃癌或者腸癌，胃腸間質瘤比較少見。它是一組的疾病，有偏良性、偏惡性情況，還有在良惡性之間的腫瘤，所以治療要分層進行。