多數腎結石不會引起腰部明顯酸痛或者疼痛的感覺，因為腎如同樹杈，空間比較大，一般不是結石摩擦腎盞、腎盂內壁，使其劃破而引起疼痛、出血。患者出現腎疼痛感覺是因為出現腎臟積水，腎包膜受到牽張，尤其是短期內增加的積水，包膜牽張力越大，疼痛感覺會越強烈。如果結石在腎內沒有引起腎臟積水，則出現疼痛情況較為少見，除非合并感染等才會導致結石向下排，排到腎盂、輸尿管連接部位或者排到輸尿管位置。因為相對空間比較小，結石相當于堵在下水道，影響尿液排出，會導致腎包膜膨隆、腎臟積水，才會導致劇烈疼痛。