胃腸道間質腫瘤通過及時治療能治療好，但是其也跟腫瘤的良惡性相關，治療及時，預后會更好，具體如下： 1、良性胃腸道間質瘤通過手術切除可以徹底治愈，術后沒有問題； 2、惡性間質瘤如果需要治療，需結合其惡性程度、腫瘤分期，個人體質有沒有淋巴結轉移、臟器轉移、手術能否徹底切除，以及術后其對格列衛等相關的化療藥物敏感性來判定其預后。綜上所述，一般胃腸道間質腫瘤的治療及時，會取得良好結果。部分晚期或者治療不及時會造成腫瘤復發轉移的患者，治療較麻煩，而且后果不好。所以早期診斷、早期治療，就會有更好的臨床結果。