胃腸道間質瘤的治療首選手術，通過根治術以后，根據分級再考慮術后輔助治療，對于手術以后局部復發或出現遠處單個轉移病灶的患者，手術還是主要治療手段。具體如下： 1、對于低危間質瘤進行根治術以后，不需要做術后輔助靶向藥物治療，即鞏固靶向藥物治療； 2、對于中危胃間質瘤不需要做術后輔助靶向治療，腸間質瘤根治術后建議做口服靶向藥物治療，主要靶向藥物是伊馬替尼； 3、對于高危間質瘤，根治術以后建議口服靶向藥物治療； 4、對于晚期沒有手術治療機會的患者以藥物為主，即伊馬替尼，爭取降期再看看能否爭取手術，如果一線治療失敗以后，二線可用抗血管靶向藥物治療，即舒尼替尼。二線治療失敗以后，三線可用瑞戈非尼。所以胃腸間質瘤藥物里面以靶向藥物治療為主。