胃腸道間質瘤有幾個類別，大多數目前都考慮是潛在惡性腫瘤： 1、部分是良性，比如來源于平滑肌良性可能性大； 2、部分神經來源是潛在惡性； 3、平滑肌和神經來源是潛在惡性； 4、未分化型絕大多數是惡性。 所以治療根據病理分型來定，其次要結合腫瘤大小，對于5.5cm以上的胃部間質瘤，絕大多數考慮惡性；對于小腸4cm以上的間質瘤也考慮惡性。考慮惡性的病人，可以考慮手術切除之后輔助格列衛進行藥物治療，能獲得比較好的治療效果。