治療肛瘺的治療如下： 1、中醫可用藥線或藥栓治療； 2、手術方式有很多種，如低位單純性肛瘺可用肛瘺單純瘺管切開或瘺管切除； 3、現在有些相對微創手術，如LIFT手術、LIFT-plug手術，所謂LIFT-plug手術，即在LIFT手術基礎上，加上生物制劑促進刀口愈合，是近年比較流行的手術方式； 4、對于復雜性肛瘺，傳統手術方式有掛線手術，有些根據醫生喜好、習慣有虛掛和實掛方法。歸根到底肛瘺治療需手術治療，但有的病人有時咨詢能否消炎即能好，肛瘺單純消炎是不能治愈，必須經過手術治療才能徹底根治； 5、一些特殊原因引起的肛瘺，如克羅恩病并發肛瘺，需先治療原發病開始，控制炎性腸病才能治療肛瘺，否則肛瘺不能根治。