治療肛瘺最有效的方式是手術(shù)治療。手術(shù)治療方式也較多，包括比較常用的竇道切開術(shù)，位置比較深或者竇道比較長的患者可以采用竇道切除術(shù)，還有竇道切除加直腸瓣轉(zhuǎn)移手術(shù)，但是沒有一種手術(shù)保證能100%治愈。尤其是高位復(fù)雜肛瘺，現(xiàn)在對于世界也是一種難題，低位特別簡單的肛瘺治療較簡單，任何醫(yī)生都能處理，但高位極其復(fù)雜的肛瘺，任何一個(gè)醫(yī)生都不敢保證100%沒有問題。因?yàn)楦丿浭中g(shù)除要切除原發(fā)病病灶之外，還要保護(hù)肛門功能，不能做完手術(shù)以后竇道好了但肛門失去功能。所以肛門手術(shù)應(yīng)該比較復(fù)雜，也是難度比較高的手術(shù)。肛瘺保守治療中沒有太好的藥物對肛瘺有治愈效果，包括現(xiàn)在的外用藥物、栓堵、生物膠等，都是配合手術(shù)中使用，起到一定輔助作用，單純藥物治療無效。