大便時肛門疼痛、出血往往提示存在肛腸疾病，主要是在肛門直腸附近出現病變，常見于肛裂。另外，外痔、肛瘺都可能引起大便時肛門疼痛、出血。所以如果存在排便時肛門疼痛、出血，需要去肛腸科進行檢查，明確是否存在痔瘡、肛裂、肛瘺。普通門診的腸鏡檢查不一定檢查肛門，因為肛門疾病屬于肛腸科的范疇。在分科比較細的三甲醫院，對于肛裂、外痔等疾病需要到肛腸外科，使用特殊的肛門鏡或者直腸鏡檢查。