口腔扁平苔蘚的病因比較復雜，是由多種因素所共同引起。口腔扁平苔蘚是一種常見的口腔黏膜慢性炎性疾病，患病率為0.1%-4%，是口腔黏膜病中僅次于復發性口腔潰瘍的常見疾病。 口腔扁平苔蘚的病因和發病機制目前尚不明確，研究結果顯示可能是與多種致病因素有關系，如免疫因素，主要是細胞介導的局部免疫應答紊亂。有研究顯示，有50%左右的口腔扁平苔蘚患者有精神創傷史，或因為生活、工作壓力過大所導致的心情不暢、情緒焦慮等。流行病學調查發現，中年女性口腔扁平苔蘚的發病率比較高。女性口腔扁平苔蘚的患者，在月經期以及在絕經期血漿中的雌二醇以及睪酮的含量都比較低。 除了上述這些因素，還可以有感染因素，如幽門螺桿菌感染，還有微循環障礙、遺傳因素、某些全身系統性疾病，以及口腔局部刺激因素等，都可以引起口腔扁平苔蘚。還有學者報道，如鋅、碘、鎂等微量元素異常，也可能與扁平苔蘚有關。