口腔扁平苔蘚的治療主要分為全身治療與局部治療，西藥用免疫抑制劑、激素、去角化的物質、維生素類藥物，在不同的階段給予不同治療方案。口腔里出現白紋時，要采用去角化治療。口腔里充血較明顯，吃刺激性食物會痛的情況下，就要使用免疫抑制劑、激素類藥物。糜爛時用不同的方案來治療，總之根據病情給予不同的方案。 中醫采用辨證論治與整體治療的方式，根據患者全身情況及不同體質給予不同方藥治療。除全身用藥之外，還給患者口腔里涂擦藥物，充血時消炎藥物逐步局部的涂擦。通過內服和外用的方法，口腔扁平苔蘚患者大部分能夠愈合。