泮托拉唑主要具有抑制胃酸的作用，此藥物對于多數患者，沒有非常明顯或嚴重的副作用，但是在使用過程中，仍然可能會有輕、中型的副作用，主要表現在以下幾方面：1、胃腸道癥狀：有些患者在使用此藥物之后，可能會出現胃腸道癥狀，可能會表現為腹瀉、腹痛，以及惡心、嘔吐等相關的不適癥狀；2、神經系統癥狀：此藥物的副作用還可能會出現在神經系統，比如患者可能會出現頭暈、頭痛等相關的不適癥狀；3、過敏反應：個別患者還可能會出現過敏的現象，可能會出現皮膚的紅斑、皮疹、瘙癢以及其他的過敏癥狀；4、白細胞、血小板減少：個別患者在長期使用此藥物后，可能會出現白細胞減少、血小板減少；5、肝功能異常：此藥物還可能會影響患者的肝功能，可能會出現轉氨酶的升高；6、疼痛癥狀：有些患者在使用泮托拉唑之后，可能會反應出現關節痛、肌肉痛等相關的癥狀。總之，泮托拉唑的副作用，主要表現在胃腸道、神經系統以及其他方面，此藥物對于多數患者而言，具有比較高的安全性。