丙硫氧嘧啶作為甲亢治療中非常常見的藥物，會有一些副作用，其副作用因人而異，不一定是吃藥就一定會有副作用，具體如下：1、肝臟毒副作用：比較常見的是對肝臟的毒副作用，比較典型的表現是會導致肝臟轉氨酶的增加，停藥后轉氨酶又可以自己恢復；2、抑制造血系統：常見的毒副作用還有對血液系統的影響，會抑制造血系統，導致白細胞和中性粒細胞下降，如果白細胞或者中性粒細胞下降比較嚴重，就會容易并發感染，因為白細胞和中性粒細胞是身體抵御細菌的防線，缺乏這2種細胞就很容易感染；3、免疫系統紊亂：不是很多見的是會導致免疫系統紊亂，導致多發性小動脈炎，部分患者吃藥后，會出現小關節疼痛、手指疼痛，做病理檢查就會發現自身免疫相關性的血管炎，稱為安卡血管炎，也會在臨床上存在。在臨床中，最常見的還是對肝臟、血液系統的影響，安卡相關性血管炎不是很多，但是也要引起重視。