肛門肌肉出現疼痛的主要原因有以下幾種：1、原發疾?。焊亻T膿腫為急性炎癥，且肛門膿腫會繼發肛瘺，肛瘺是一種慢性疾病。肛門膿腫和肛瘺感染的來源，都位于肛門括約肌間的位置，肛門括約肌間的位置存在肛門腺，腺體感染為肛門膿腫的主要致病因素。因此一旦出現肛門膿腫，或者肛瘺形成，多數患者在相應感染的肛門腺體位置上，肌肉出現僵硬，在肌肉受到刺激后，出現疼痛的感覺。有時可能在排便或久坐時發生疼痛，并且如果肛瘺形成，疼痛就會更加劇烈；2、功能性疼痛：表現為肛門括約肌痙攣性疼痛，具體的病因目前不是完全清楚，患者主要表現為肛門肌肉的痙攣，同時伴有強烈的疼痛感，這種疼痛感可能為階段性，也可能為持續性。治療肛門括約肌痙攣性疼痛主要通過物理治療，比如熱敷、坐浴或者生物反饋、局部麻醉、鎮痛等治療，經過治療后多數患者能夠得到緩解，少數患者得不到有效的治療。