醫學上沒有惡性肥厚型心肌病，就是肥厚型心肌病，肥厚型心肌病分為梗阻性肥厚型心肌病和非梗阻性肥厚型心肌病。對于非梗阻性肥厚型心肌病，主要是藥物治療，比如常用β阻滯劑倍他樂克減緩病人的心室率，或加用二氫吡啶類藥物，比如常用的地爾硫卓類藥物，主要目的是為了減少心臟的做功，緩解病人的缺血癥狀。 對于梗阻性肥厚型心肌病，除了以上藥物的治療，還有內科介入方法，可以采用化學消融的方法，消融肥厚的心肌，主要機理就是酒精消融，把酒精注射到肥厚的心肌下面，人為造成一次心肌的缺血壞死，使肥厚心肌缺血壞死；還可以通過外科手術的方法把心肌切開，肥厚梗阻的心肌可用外科手術的方法切除，再進行縫合，達到解除梗阻的目的。