肥厚型心肌病治療主要包括藥物治療和非藥物治療，具體如下： 1、藥物治療，主要目標是減輕癥狀、改善并發癥。肥厚型心肌病用藥種類非常少，主要是β受體阻滯劑和鈣離子通道阻滯劑。當肥厚型心肌病發展到最后出現心衰時，就需要進行抗心衰治療，抗心衰治療和普通心衰治療基本一致。若并發有房顫發生，要注意抗心律失常治療和預防血栓治療； 2、非藥物治療，主要指各種手術治療，手術治療目的是減輕梗阻癥狀、減少或者降低猝死風險。最傳統非藥物治療主要是外科心肌切除術，可切除梗阻的心肌、減輕流出道梗阻，從而降低猝死風險。較新式微創介入的方法有室間隔酒精消融術和射頻消融術，以上兩種方法的優勢都是在于微創，并且可以重復進行手術，創傷相對較小，安全性較高。 除此之外，有一些新治療理念正在實踐，即通過改變心臟的傳導順序降低流出道壓差，但是該方法并沒有得到公認。