肥厚型心肌病的治療目的主要是預防猝死、改善生活質量，讓病人通過治療回歸正常的生活、工作狀態，延長病人的壽命。肥厚梗阻型心肌病的治療更要預防猝死，因為梗阻型的肥厚型心肌病是出現心臟猝死的非常重要病因。預防猝死主要是用β受體阻滯劑，有時可能會需要用外科治療或心臟介入手術治療，讓肥厚的心肌變薄，有的病人可能需要植入體內的自動復律除顫器即ICD，預防心律失常猝死的發生。因為肥厚心肌的持張性比較差，心肌耗氧量也比較多，病人容易出現心絞痛，出現活動耐量的下降、呼吸困難，有的病人會出現水腫。這種情況要通過對心衰的治療去改善。一般用β受體阻滯劑，有時需要謹慎應用利尿劑進行肺水腫的治療，改善生活質量。肥厚型心肌病沒法根治，現在還做不到把肥厚心肌完全變成正常心肌，也沒有基因治療。通過藥物治療和其他手術治療，盡量讓病人回歸正常工作生活，和同齡人一樣能上班、帶孩子出門玩。通過治療達到治療目的，回歸正常生活，帶著慢性病生存。通過預防猝死、治療心衰延長病人壽命，盡量能達到正常壽命。