肥厚型心肌病一般沒有特效藥物進行治療，主要都是通過強心、利尿，以及其他的治療一些結構性心臟疾病來改善癥狀，藥物治療的作用有限。肥厚型心肌病常見的原因，主要是各種原因造成的心肌負荷過重，可以出現胸悶，嚴重的可能會造成暈厥等其他并發癥的發生。藥物治療方面，可以進行一些利尿治療，主要是使用呋塞米、螺內酯等藥物。如果肥厚型心肌病，特別是左心流出道梗阻，有的需要進行手術治療。如果是瓣膜性疾病造成心肌肥厚，從而引起的相關疾病，要進行結構性矯治。左心衰的肥厚性心肌病造成的左心流出道的狹窄，一定要進行手術治療，沒有特殊的藥物進行治療。藥物的治療，主要是使用β受體阻滯劑，如美托洛爾等相關藥物，這樣可以減少肥厚型心肌病出現相關的癥狀。所以肥厚型心肌病可以使用相關的藥物減少病情的發展、減輕癥狀。