呼吸性酸中毒患者多合并缺氧癥狀，即呼吸衰竭，嚴重者可能出現二氧化碳麻痹，甚至心跳停止，需緊急采取搶救措施。因此，呼吸性酸中毒是一種較為嚴重的疾病，建議患者及時進行治療，其預后與病因有關，如病因為氣胸、胸腔積液或鎮靜麻醉藥中毒等可逆因素，通過及時的病因治療，患者的預后一般良好；如病因為重癥肌無力、腦血管意外或腦外傷等導致的中樞性呼吸抑制，患者的預后可能稍差；如病因為慢性阻塞性肺病，患者通過積極處理，癥狀一般可得到緩解，但將逐年加重。