癲癇手術是一個比較復雜的手術，手術方式有很多種，不同手術方式花費差別非常大。 常見的病灶切除癲癇手術，其費用目前在醫院一般為4-5萬元。復雜的手術如深部電擊刺激、迷走神經刺激，費用相對較高，可能要十幾萬元甚至二十幾萬元。所以癲癇手術費用必須按照手術種類、方式，甚至是手術當中所用材料不同而決定手術和住院費用。 部分癲癇手術需要做兩次，甚至三次。因為首先要植入一次電極，為了精確的找到放電灶，為第二次精準切除放電灶做鋪墊。所以兩次手術費用相對較高，顱內電極植入的數量也很大程度上決定了癲癇手術的費用。