不同類型的癲癇，手術費用不同，甚至相差很大。繼發性癲癇如腦腫瘤、腦血管畸形等，一般手術治療費用5-7萬元左右；深部或者較大腦腫瘤病人費用可能多達10萬元以上。 大型腦血管畸形如行神經介入手術或分期手術，最高費用可達數十萬元。原發性癲癇病人行病灶切除術，費用大概5-10萬元之間，若要行神經調控手術治療費用20-40萬元之間，其費用主要是安裝起搏器的材料費用。 癲癇手術除神經調控手術治療的材料費以外，大部分社保都予以結算報銷。神經調控手術的材料費主要是起搏器和電池的費用，進口的起搏器和電池的費用大概10-15萬元，國產的稍微便宜也要10萬元左右。