根據目前的研究結果，雙歧桿菌相對安全性較高，孕婦、兒童也可使用。因此，如果從安全性考慮，雙歧桿菌可以長期服用，但是建議根據疾病情況決定，無需長期服用。如果最近一直不適可以連續服用，緩解后可以改成間斷服用，而并不需要長期服用。 雙歧桿菌屬于益生菌，益生菌目前在臨床上是一類常用藥物，不管對于功能性疾病還是器質性疾病，都有一定治療或輔助治療效果。對于很多腸道炎癥性疾病、感染性疾病，甚至有非特異性腸道炎癥性疾病，如慢性潰瘍性結腸炎，益生菌包括雙歧桿菌都是有一定的輔助治療效果。而對于功能性疾病，如便秘和腹瀉，益生菌也可以起到很好的輔助治療效果。因此，雙歧桿菌在臨床上的治療效果是根據本身疾病來判斷。