咳嗽時可以做胃鏡，但需要根據咳嗽的程度不同選擇不同類型的胃鏡方式。做胃鏡時，必須通過咽喉，將胃鏡管插入至食管和胃部，若咳嗽較劇烈，會影響到做胃鏡。做胃鏡檢查過程中，若患者忍不住劇烈咳嗽、惡心，會使胃鏡無法進行，也會影響胃鏡檢查結果。因此，最好能夠選擇麻醉胃鏡，即無痛胃鏡，在全麻下進行，全程患者沒有知覺。麻醉師也會根據患者的具體情況，調整用藥劑量，以便在麻醉過程中，患者可以順利操作，不受咳嗽干擾。但對于輕度咳嗽，也可行普通胃鏡，如在行普通胃鏡前，會含服一種局部麻醉劑，比如達克羅寧。此藥對咽部有一定的麻醉作用，能夠阻斷各種神經沖動或刺激傳導，抑制觸覺和痛覺，有止痛、止癢及殺菌的作用。