慢性腸炎通常無法根治。慢性腸炎主要是炎癥性腸病，最常見的是潰瘍性結腸炎和克羅恩病。上述兩種疾病與免疫系統紊亂有關，可以導致持續性反復發作的嚴重變化。 慢性腸炎的患者臨床表現包括腹痛、腹瀉、便秘，甚至出血、嚴重營養不良，發展到一定程度時可能會導致腸惡性病變，可以出現結腸癌或者腫瘤等。該病在治療上很有難度，目前屬于消化系統疾病中治療十分困難的疾病，所以需要長時間、規范、系統的治療。