大便有出血、肛門疼，應該到結直腸肛門外科或者肛腸外科檢查，明確造成大便出血，伴肛門疼痛的原因，根據不同疾病做不同處理，常見的疾病如下：1、痔瘡：痔瘡出血伴肛門疼痛，可以用痔瘡膏和痔瘡栓，如馬應龍痔瘡膏、復方角菜酸酯乳膏、復方角菜酸酯栓等進行治療。痔瘡出血可以口服地奧司明、邁之靈減輕靜脈曲張、水腫，降低出血；2、肛裂：如果是陳舊性肛裂，可能需要手術治療；3、肛門肌肉問題：肛門肌肉如果有痙攣或失弛緩的情況，可能需要肛門周圍進行肉毒素注射、肛門解痙治療；4、腫瘤：直腸和肛門腫瘤，如直腸下端的直腸癌或肛管癌等，可能需要手術治療。如果腫瘤處于晚期不能手術，可能需要放療或者化療等；5、膿腫：直腸壁內膿腫、肛門周圍膿腫引起的破潰、出血，這時可能也需要進行手術、引流等治療。